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MPI-multicore: Applicazioni

  • SISSA, Stefano Cozzini
    • Quantum/espresso: L'utilizzo sara' principalmente su nodi multicore ( wholenode); possibile necessita' di 32/64 core. Il codice richiede Intel compiler per essere efficiente + MKL +FFTW3
    • RegCM: qui continueremo la sperimentazione all'interno di un nodo multicore (wholenodes). L'idea e' di girare in grid la verfica e la validazione dei vari modelli: quindi molti run brevi ma non lunghissimi. Le dipendenze software qui sono nulle perche' manderemo in grid il relocatable package che contiene tutto quanto
    • LAMMPS: codice di dinamica molecolare che e' usato da studenti Sissa e con il quale vorremmo fare qualche esperimento in grid. L'idea anche qui e' di usarlo su architetture multicore per molti runs indipendenti.
    • Refs:Calculation of Phonon Dispersions on the Grid Using Quantum ESPRESSO - Protein Folding by Bias Exchange Metadynamics on a Grid Infrastructure

  • CNR-BO Quantum/espresso in modalita' MPI; primo test su Napoli con inserimento di Degli Esposti nella VO unina.it

  • Parma: Roberto De Pietri con una applicazione di cromodinamica quantistica, e di gravitazione numerica, gia' inproduzione sul cluster Theophys di Pisa .

  • INAF: Ugo Becciani, con applicazioni di "GAIA Mission" di tipo parallelo/seriale, disponibilita' di tempo dall'inizio di maggio

  • INGV; Massimiliano Drudi con l' applicazione parallela "NEMO" di OCEANOGRAFIA. Non richiede un elevato numero di nodi e si decide di cominciare a farla girare sul sito di Perugia (A.Costantini). Disponibilita' di Drudi dal 10 di aprile.


Sommario requirements:

  GAIA Einstein-Tk Reg-CM
Parallelismo
MPI/openMP, ibrido,      
Codice      
proprio/comm/ Open      
Generazione codice
precomp/ compliato su WN, ..      
Compliatori su WN
C/C++/Fortran/Java      
Interpreti su WN
C/C++/Fortran/Java      
Applicazioni specifiche
C/C++/Fortran/Java      
Librerie dinamiche
BLAS/        
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Topic revision: r6 - 2012-10-06 - RobertoAlfieri
 
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