Riunione MPI-multicore del 1/06/2012

Location: INFN-CNAF, Via Ranzani Bologna, sala Riunioni Asinelli , dalle 14:00 alle 16:00

Presenti

A Bologna: Roberto Alfieri, Massimo Drudi, Antonia Ghiselli, Marco Bencivenni.

In remoto; Vania Boccia, Giovanni Barone, Luisa Carracciuolo, Enrico Mazzoni, Daniele Cesini e Alessandro Costantini.

Minute

Stato dei siti

I siti di Parma, Napoli Pisa e Perugia sono attivi e correttamente configurati nel TOP BDII di produzione. Il sito di Bologna/IGI e' in ritardo a causa del ritardo di consegna del materiale.

Deployment: problematiche di installazione e configurazione del supporto MPI in EMI-1

Occorre prestare attenzione nella configurazione Yaim del CE: il profilo MPI_CE deve esistere e deve essere il primo della lista. E' necessario pubblicare anche nel sistema informativo il tipo di rete (MPI-Ethernet | MPI-Infiniband)

Ambiente Hardware

Sono state inserite alcune note sull'utilizzo degli attributi "Wholenodes" e Mpi-start; Attributi "WholeNodes"

Si ritiene necessario poter configurare l'LRMS in modo da supportare il Job packing (per ottimizzare l'uso delle risorse), la classificazione e la gestione dei diversi tipi di job (seriali, paralleli, memory-bound): Sono in corso contatti con D. Salomoni per la parte LSF.

Ambiente Software

Si ritiene necessario determinare un metodo standard per configurare e pubblicare l'ambiente software (librerie tools, compilatori, ..) disponibili nei siti. Anche l'installazione del profilo WN e del profilo WN-MPI dovrebbero configurare un ambiente software "di base" per appicazioni scientifiche quali : compilatori (gcc/gfortran, openMPI), librerire sceintifiche (Gsl, Atlas, LaPack, Blas, Fftw3), librerie formattazione dei dati (hdf5, netcdf)

I colleghi di Napoli hanno preparato la bozza di una proposta per la standardizzazione del middleware applicativo: /MPI/AmbienteSoftwareApplicazioni Aggiungeranno i punti emersi durante la discussione, ma e' importante avere contributi anche dagli utenti.

Gestione e utilizzo dei dati

Un aspetto importante nella gestione dei dati e' la possibilita' di accedere a stdout e stderr durante l'esecuzione del job. Questa funzionalita' e' gia stata aggiunta nel portale (Marco B e Alessandro C.) per una specifica applicazione: ogni ora i dati dell'applicazione vengono copiati su uno Storage Element e pubblicati via https. Occorrera' valutare se la funzionalita' puo' essere estesa in modo trasparente a tutta la VO gridit (o altre).

Stato del portale Siamo in attesa che si completi l'iter burocratico per l'attivazione dell'autenticazione via Idem. La CA-onfine e' in stato avanzato di integrazione.

Stato delle applicazioni

Ora che l'infrastruttura e' pronta le applicazioni devono essere portate al piu' presto, in modo da terminare possibilmente le attivita' entro l'estate. Al momento solo Einstein Toolkit (DePietri) e Nemo (Drudi) sono pronte.

- Partecipazione a Workshop, e congressi.

Coordinate per l'accesso via EVO:

Title:        MPI Multicore
Description:   
Community:    Universe

Meeting Access Information:
- Meeting URL
http://evo.caltech.edu/evoNext/koala.jnlp?meeting=vsvivIeseaIBIlaiavItas

Phone Bridge ID è 536 8640